Община бахаи в Азербайджане существует с самого момента возникновения этой веры - с середины XIX в. В годы Советской власти вера бахаи, как и другие религии, не могла исповедоваться открыто. После распада СССР и восстановления государственной независимости Азербайджана в стране постепенно начала восстанавливаться и свобода вероисповедания. В 1992 г., после принятия Милли Меджлисом Азербайджанской республики Закона о свободе вероисповедания, бахаи Азербайджана получили возможность официально создавать общины. В1993 году решением Коллегии Министерства Юстиции Азербайджанской Республики было дано официальное разрешение на деятельность Общины Бахаи г. Баку. В 2002 году в Государственном Комитете по работе с Религиозными организациями Азербайджанской Республики Бакинская община была перерегистрирована. В том же году была также зарегестрирована Сумгаитская община Бахаи.
В 2004 г. получило официальную регистрацию Национальное Духовное Собрание Бахаи Азербайджана - центральный орган национальной общины бахаи. Бахаи в Азербайджанской Республике после демократических преобразований, наряду с другими гражданами, живут полноценной жизнью.